3 педиатрическое инфекционное отделение Является единственным отделением по лечению коклюша в Москве. В отделении проводится лечение пациентов с диагнозом ОРВИ с синдромом крупа и бронхообструктивным синдромом, в том числе у детей грудного возраста.
4 педиатрическое инфекционное отделение
Отделение профилируется на лечении респираторных заболеваний с кишечным синдромом, кишечных инфекций вирусной этиологии. На базе отделения располагается кафедра инфекционных болезней у детей РНИМУ им. Н.И.Пирогова
5 педиатрическое инфекционное отделение
В отделение проходят лечении дети, в том числе и грудного возраста, с острыми вялыми параличами, вирусными менингитами, менингоэнцефалитами, Лайм-боррелиозом, с подозрением на клещевой энцефалит. На базе отделения располагается клинический отдел Института полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П.Чумакова.
13 педиатрическое инфекционное отделение
Отделение для лечения детей старшего возраста от 3 до 14 лет с ОРВИ и ее осложнениями, острым тонзиллитом, инфекционным мононуклеозом